В Сан-Диего действует большое количество музеев, среди которых встречаются по-настоящему интересные. В одном только парке Бальбоа наберется с десяток, в числе которых несколько художественных, технических, историко-культурных, научных и естественно-научных музеев. Многие из них могут похвастать абсолютно уникальными экспонатами и артефактами, имеющими мировую ценность.
Кроме того, в районе Старого города Сан-Диего также находится большое количество музеев. Все они хоть и небольшого размера, но представляют собой отреставрированные исторические здания периода колонизации Калифорнии, которые можно увидеть изнутри.
Аэрокосмический музей Сан-Диего
Данный музей находится в парке Бальбоа, в бывшем здании Форд, которое находится в Национальном реестре исторических мест. Аэрокосмический музей был впервые открыт для публичного посещения в 1963 году. Его экспозиция делится на несколько галерей, выставки в которых знакомят посетителей со вкладом Сан-Диего в развитие мировой авиации. В нем имеется галерея первой и второй мировой войны, "Золотого века авиации", современных космических и реактивных летательных аппаратов и многие другие.
Маяк Пойнт-Лома
Расположенный на полуострове Пойнт-Лома старый маяк уже не используется по назначению, но действует как музей. Его ошибочно называют "Старым испанским маяком", но построен он был совсем не во времена мексиканского или испанского Сан-Диего. Строительство маяка было окончено в 1854 году, когда город уже принадлежал США. В свое время он был самым высоким (122 м) из американских маяков. Музей при маяке может похвастать оригинальными картами и линзами, обстановкой и историческими документами, которые рассказывают о жизни в этом месте. Сама башня маяка закрыта для посещений и лишь два раза в году ее разрешается осмотреть - 15 ноября в день рождения маяка и 25 апреля в день рождения Национальной парковой службы.
Музей железнодорожного моделизма Сан-Диего
Этот музей площадью 2500 кв. метров является крупнейшей экспозицией подобного рода в Соединенных штатах и одной из самых больших во всем мире. Он также находится в парке Бальбоа и с 1982 года успел принять порядка 3 миллионов посетителей. В музее можно увидеть одни из самых больших в мире модельных железных дорог масштаба N и НО. Кроме того, здесь есть галерея трехрельсовых игрушечных поездов. Она включает в себя 4 железнодорожные линии с реалистичным пейзажем и неограниченными возможностями управления.
Музей человека в Сан-Диего
Этот антропологический музей привлекает к себе внимание уже зданием, в котором он находится. Это великолепное сооружение, историческое здание Калифорнии, выполненное в разных стилях от готики и барокко до рококо. Его фасад украшает резьба по камню и многочисленные каменные скульптуры. Сам музей насчитывает свыше 100 тысяч этнографических ценностей, более 30 тысяч книг и 25 тысяч фотографий. Его коллекция хранит материалы, полученные от разных индейских племен, и артефакты таких средне-американских цивилизаций как майя. Также музей содержит одно из наиболее существенных собраний древнеегипетских артефактов на территории Америки. Это и настоящие мумии, и статуэтки, и похоронные маски, и расписанные деревянные саркофаги.
Национальный памятник Кабрильо
Часть территории на мысе Пойнт-Лома отведена под отдельный парк - национальный памятник Кабрильо, названный в честь капитана первой европейской экспедиции, высадившейся в бухте Сан-Диего в 1542 году. С мыса парка открывается живописная панорама гавани и города. В ясную погоду отсюда хорошо видно Тихий океан. В скалистых склонах полуострова океанские волны выточили огромное количество пещер и гротов. В память о первооткрывателе в октябре проводится ежегодный фестиваль, а также праздники индейцев с танцами, песнями и традиционной едой.
Художественный музей Сан-Диего
Расположенный на бульваре Эль-Прадо в парке Бальбоа, этот музей располагает огромной коллекцией ценных экземпляров испанского искусства. Открытый в 1926 году в качестве художественной галереи, музей является самым старым и большим в регионе. Ежегодно его посещает свыше 500 тысяч человек. Наибольшую ценность представляют творения таких великих испанцев как Эль Греко, Мурильо, Риберы и Зурбарана. Также в музее имеются картины кисти итальянских и немецких художников.